一、機械破碎法：是指利用搗碎機、研磨器或勻漿器 等將細胞破碎開來 。

1. 高速組織搗碎：將材料配成稀糊狀液，放置于筒內約1/3體積，蓋緊筒蓋，將調速器先撥至慢處，開動開關后，逐步加速至所需速度。此法適用于動物內臟組織、植物肉質種子等。

2. 玻璃勻漿器勻漿：先將剪碎的組織置于管中，再套入研桿來回研磨，上下移動，即可將細胞研碎，此法細胞破碎程度比高速組織搗碎機為高，適用于量少和動物臟器組織。

二、物理破碎法：指利用溫度差、壓力差或超聲波等將細胞破碎開來。

1．用一定功率的超聲波處理細胞懸液，使細胞急劇震蕩破裂(借助超聲的震動力破碎細胞壁和細胞器）。
機制：可能與強聲波作用溶液時，氣泡產生、長大和破碎的空化現象有關，空化現象引起的沖擊波和剪刀力使細胞裂解。
超聲波破碎的效率取決于聲頻、聲能、處理時間、細胞濃度和細胞類型等。（使用時注意降溫，防止過熱）。

2. 高壓破碎：細胞懸浮液從高壓室的環狀隙噴射到靜止的撞擊環上，被迫改變方向經出口管流出。此過程中細胞經歷了高速造成的剪切的碰撞及高壓到常壓的變化，從而破碎釋放內含物。
這是一種溫和的、*破碎細胞的較理想的方法。

3. 反復凍融法：將細胞在-20度以下冰凍，室溫融解，反復幾次，由于細胞內冰粒形成和剩余細胞液的鹽濃度增高引起溶脹，使細胞結構破碎。