儀器設備驗收工作中存在的問題：

1、采購方式的變化使儀器設備驗收工作難度加大
（1）政府采購的全面介入，使采購工作步入了新的軌道。政府采購相對舊有的自行采購而言更加公開、公平、公正，采購程序更加規范，采購結果也更具性。政府采購通常會采用大批量、捆綁式的運作方式來降低采購成本，但此類運作方式會增加采購中間環節，增加儀器設備驗收工作中的部門溝通工作的工作量。
（2）供應商資質門檻的提高有時會造成需要跨地區甚至跨省供貨的情形，距離的拉大帶來的是高校與供貨商溝通難度的增加，無形中也增加了驗收工作的難度。

2、崗位配置對儀器設備驗收工作產生一定的影響
對實驗室與設備管理處工作人員的崗位配置各有不同；
編制充足的在實驗室與設備處下設置了專門管理儀器設備驗收工作的科室，由專人專管該項工作；

但大多數的編制并不充足，甚至有的高校沒有設置實驗室與設備管理處這一部門，相關的工作職責由教務處下設的科室承擔；